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1. 理事会
由政府（科技，卫生部门）主管部门领导及推举出的生物医学和临床医学领域的权威专家担任。主要负责审核考评执行委员会的工作，审核其上报的预算计划，监督所属工作委员会的人员选举，协调对接国家重大发展计划以及协调生物样本库在跨部门工作中的协调问题等。
2. 科学委员会
科学委员会的职能是综合考虑国家战略的需求和国内技术力量的储备，以解决国内临床上的实际问题为出发点，一方面指导生物样本库的建设方向和技术发展方向；另一方面本着积极科学的态度，判断各单位对于生物样本库内资源利用的请求，确认其科学性和技术可行性，提高样本使用的效率和科研水平。
3. 伦理和法律委员会
由国内外伦理研究者，律师，医生，科研工作者等共同组成。伦理委员会成员应有足够的权力和独立性，他们参与到样本库建设的每一个子项目中来，重点探讨样本库建设的子项目对社会伦理带来的影响，并给与合理适当的建议。解决样本库建设和利用过程中的伦理法律问题，并为国家制定相关法律法规和决策提供依据。
4. 执行委员会
由样本库的牵头单位及参加样本库建设的单位所选派的代表组成。其工作内容主要是负责领导下属的技术平台，质量控制平台和各医院建设的样本库制定具有国际先进水平的标准规范，监督规范的认真严格执行；建立统一的信息交换平台，促进样本的科研合作和利用；提供人员培训服务，满足样本库建设需要；发展特色技术服务，提高样本的使用效率，满足医院对科研的需要。 |
